繼江西科學(xué)家破解“雷竹”全基因組,江西省林業(yè)科學(xué)院再傳來喜訊。該院聯(lián)合省林業(yè)科技實(shí)驗(yàn)中心在期刊《Scientific Data》(中國科學(xué)院二區(qū)期刊,5年影響因子8.7)發(fā)表題為“Chromosome-level genome assembly of the endangered tree species Ormosia henryi Prain”研究論文,在國內(nèi)率先獲得首個染色體級別花櫚木全基因組,填補(bǔ)了花櫚木遺傳學(xué)研究的空白。
說起花櫚木,你或許較為陌生,但一定聽過“花梨木”。沒錯,“花梨木”就是花櫚木的民間叫法。作為豆科、紅豆屬常綠喬木,花櫚木被譽(yù)為“才貌雙全”樹,其在我國的應(yīng)用史可追溯到唐代,可謂“全身都是寶”——外形樹大蔭濃,樹干挺拔,壽命長且蟲害少,是優(yōu)秀的景觀樹。木材是上等木料,大名鼎鼎的龍泉寶劍,其劍鞘就是用花櫚木做成的。根、根皮、莖及葉均可入藥,提取物還可穩(wěn)定人體中樞神經(jīng)系統(tǒng)。另外,果實(shí)成熟時狀如紅豆,又使花櫚木成了“愛情樹”。
為何要開展花櫚木的遺傳學(xué)研究?原來,花櫚木因種子自然萌發(fā)率低,加之環(huán)境影響等種種原因,野生種群資源稀少,屬于我國珍稀瀕危樹種,為國家二級保護(hù)野生植物,被《中國物種紅色名錄》《國家重點(diǎn)保護(hù)野生植物名錄》收錄。
花櫚木集中分布于我國東南部地區(qū),其中核心分布區(qū)主要位于江西、湖南、福建等省區(qū),野外種群極少。2020年,江西省瑞金市贛江源保護(hù)區(qū)發(fā)現(xiàn)了野生花櫚木的身影;2023年,江西省彭澤縣桃紅嶺梅花鹿國家級自然保護(hù)區(qū)也發(fā)現(xiàn)小群落,包括3株成熟喬木和12株幼苗,處于良好的自然野生狀態(tài)?。
搶救這一珍稀樹種,“基因方案”有望給出答案。
研究表明,花櫚木基因組總大小為2.69Gb,BUSCO評估驗(yàn)證基因組完整性達(dá)98.20%,其中共功能注釋到37366個基因,鑒定到2518個rRNA和1120個tRNA等非編碼RNA,為紅豆屬物種里少有的大基因組。
該成果的發(fā)布,為解析豆科基因組擴(kuò)張機(jī)制提供了新視角,同時為花櫚木藥用成分生物合成途徑的解析及紅豆屬相關(guān)瀕危物種的保護(hù)與資源綜合開發(fā)利用提供了重要分子依據(jù)與理論基礎(chǔ)。
此外,研究團(tuán)隊(duì)在前期資源收集、群體遺傳結(jié)構(gòu)解析基礎(chǔ)上,首次發(fā)現(xiàn)了花櫚木樹體揮發(fā)性成分中21種抗抑郁成分及4種核心物質(zhì),論證了該樹種抗抑郁森林康養(yǎng)價值。
據(jù)悉,近10年來,江西省林業(yè)科技實(shí)驗(yàn)中心與江西省林科院聯(lián)合開展花櫚木資源保護(hù)、評價與可持續(xù)利用技術(shù)研究,在全省野外回歸種植1.2萬株。
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